设施菜地复种指数高，每茬单产都较高，因此从菜地带走的养分种类多、数量大。设施内光照弱、通风差，病虫害不断加重。设施菜地因施肥与蔬菜吸收不匹配，使部分养分亏缺，部分养分富余残留在土壤中，造成盐积化或酸化。

土壤微生物种群生态平衡被打破，有益微生物抗性差，数量和生物量逐步减少;有害微生物生存繁衍能力强，数量和生物量增加。种种原因，都造成设施菜地土壤质量随种植年限增加呈劣化态势，而且修复难度不断加大。因此，采取科学合理的技术措施，修复设施菜地耕性，持续提高土壤质量和地力，是设施蔬菜产业发展的一项长期工作。