微喷灌技术和喷灌技术、滴灌技术等节水灌溉技术相比，有其独特的优点。具体表现如下：
（1）节约用水
 灌溉水的利用效率高。微喷灌的节水主要体现在减少含水土壤面积、控制灌水深度，减少蒸发和渗漏损失。在果园中，湿润面积仅占作物生长总覆盖面积的40%~75%.其次，通过选择微喷头的最适宜降水特性，使土壤湿润体内水的利用率得到进一步的提高。
 （2）系统组合性能强，使用方便
主要体现在通过调整喷嘴和分水器，形成多种喷洒直径和降雨强度的组合，从而适应了果树从幼树生长为成树的不同需要；某些情况下微喷灌系统还可以很容易地转化成滴灌系统；微喷头可随时调整其工作位置，如树上、行间或株间等。
（3）节省能源
微喷头的设计工作压力一般在15~20m水头之间，又是局部供水，与喷灌相比大大减少了系统的供水量和扬程，节省能源的作用明显。
（4）控制杂草生长
当喷洒水直径不超过树荫覆盖时尤为明显，暴露在阳光下的地面得不到水分供应，杂草相应减少。
（5）受风的影响小于喷灌系统
因微喷头工作位置低，喷洒仰角小，在多风季节仍可作业。
（6）降低系统投资
因为采用了低压小流量的供水方式，对系统供水能力的要求降低了，从而使各级管道的口径减小，并降低了管材的压力等级，减少了系统的动力功率，使系统的总投资大大下降。
（7）可控制叶面潮湿
对于使用污水和咸水灌溉时，可防止损害作物叶子，相反当需要湿润叶面或改善田间小气候时，可将微喷头移至树冠上，还可用以防止霜冻灾害。
（8）有助于开发利用盐碱土壤
对盐碱土壤上的作物，可利用微喷灌在作物根系区创造一个低盐浓度的区域，保证作物的正常生长。
（9）对田间作业的干扰小
 因管道和微喷头便于移动，不影响田间农机作业。